Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCP4P48539 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PCP4P48539 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCP4P48539 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCP4P48539 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCP4P48539 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCP4P48539 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PCP4P48539 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCP4P48539 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCP4P48539 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCP4P48539 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCP4P48539 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCP4P48539 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCP4P48539 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PCP4P48539 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PCP4P48539 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCP4P48539 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCP4P48539 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCP4P48539 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCP4P48539 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PCP4P48539 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCP4P48539 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCP4P48539 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PCP4P48539 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCP4P48539 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCP4P48539 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCP4P48539 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCP4P48539 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PCP4P48539 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCP4P48539 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCP4P48539 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCP4P48539 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PCP4P48539 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCP4P48539 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCP4P48539 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PCP4P48539 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PCP4P48539 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCP4P48539 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCP4P48539 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCP4P48539 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCP4P48539 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PCP4P48539 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCP4P48539 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCP4P48539 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PCP4P48539 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PCP4P48539 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCP4P48539 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCP4P48539 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PCP4P48539 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCP4P48539 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCP4P48539 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCP4P48539 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PCP4P48539 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCP4P48539 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PCP4P48539 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCP4P48539 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PCP4P48539 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCP4P48539 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCP4P48539 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCP4P48539 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCP4P48539 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCP4P48539 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCP4P48539 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCP4P48539 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCP4P48539 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCP4P48539 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCP4P48539 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCP4P48539 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCP4P48539 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCP4P48539 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCP4P48539 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCP4P48539 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCP4P48539 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCP4P48539 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCP4P48539 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCP4P48539 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCP4P48539 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCP4P48539 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCP4P48539 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCP4P48539 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCP4P48539 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCP4P48539 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCP4P48539 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCP4P48539 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCP4P48539 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCP4P48539 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCP4P48539 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCP4P48539 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCP4P48539 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCP4P48539 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCP4P48539 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCP4P48539 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PCP4P48539 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCP4P48539 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PCP4P48539 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCP4P48539 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PCP4P48539 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PCP4P48539 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PCP4P48539 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCP4P48539 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms