Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNPDA1P46926 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNPDA1P46926 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNPDA1P46926 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GNPDA1P46926 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPDA1P46926 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPDA1P46926 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNPDA1P46926 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNPDA1P46926 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNPDA1P46926 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNPDA1P46926 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNPDA1P46926 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPDA1P46926 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPDA1P46926 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPDA1P46926 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNPDA1P46926 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNPDA1P46926 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GNPDA1P46926 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GNPDA1P46926 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GNPDA1P46926 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GNPDA1P46926 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GNPDA1P46926 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms