Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
RANGAP1P46060 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC43.36■■■■■ 4.53
RANGAP1P46060 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
RANGAP1P46060 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
RANGAP1P46060 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
RANGAP1P46060 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
RANGAP1P46060 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.26■■■■■ 4.52
RANGAP1P46060 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RANGAP1P46060 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
RANGAP1P46060 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
RANGAP1P46060 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
RANGAP1P46060 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.2■■■■■ 4.51
RANGAP1P46060 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.51
RANGAP1P46060 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RANGAP1P46060 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RANGAP1P46060 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
RANGAP1P46060 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
RANGAP1P46060 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RANGAP1P46060 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RANGAP1P46060 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
RANGAP1P46060 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
RANGAP1P46060 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
RANGAP1P46060 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
RANGAP1P46060 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
RANGAP1P46060 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
RANGAP1P46060 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
RANGAP1P46060 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
RANGAP1P46060 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
RANGAP1P46060 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
RANGAP1P46060 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
RANGAP1P46060 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
RANGAP1P46060 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
RANGAP1P46060 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
RANGAP1P46060 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
RANGAP1P46060 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
RANGAP1P46060 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
RANGAP1P46060 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
RANGAP1P46060 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
RANGAP1P46060 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
RANGAP1P46060 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
RANGAP1P46060 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
RANGAP1P46060 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
RANGAP1P46060 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
RANGAP1P46060 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
RANGAP1P46060 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
RANGAP1P46060 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.89■■■■■ 4.46
RANGAP1P46060 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
RANGAP1P46060 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC42.88■■■■■ 4.46
RANGAP1P46060 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
RANGAP1P46060 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
RANGAP1P46060 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
RANGAP1P46060 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
RANGAP1P46060 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
RANGAP1P46060 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
RANGAP1P46060 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.82■■■■■ 4.45
RANGAP1P46060 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
RANGAP1P46060 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
RANGAP1P46060 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
RANGAP1P46060 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
RANGAP1P46060 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
RANGAP1P46060 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
RANGAP1P46060 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
RANGAP1P46060 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
RANGAP1P46060 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
RANGAP1P46060 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
RANGAP1P46060 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
RANGAP1P46060 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.74■■■■■ 4.43
RANGAP1P46060 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
RANGAP1P46060 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
RANGAP1P46060 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
RANGAP1P46060 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms