Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MDH1P40925 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MDH1P40925 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MDH1P40925 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDH1P40925 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDH1P40925 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDH1P40925 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDH1P40925 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDH1P40925 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDH1P40925 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDH1P40925 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MDH1P40925 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MDH1P40925 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MDH1P40925 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MDH1P40925 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDH1P40925 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDH1P40925 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDH1P40925 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MDH1P40925 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MDH1P40925 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MDH1P40925 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDH1P40925 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDH1P40925 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MDH1P40925 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDH1P40925 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDH1P40925 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MDH1P40925 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MDH1P40925 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MDH1P40925 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MDH1P40925 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MDH1P40925 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MDH1P40925 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDH1P40925 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDH1P40925 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDH1P40925 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDH1P40925 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDH1P40925 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDH1P40925 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDH1P40925 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDH1P40925 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MDH1P40925 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDH1P40925 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDH1P40925 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MDH1P40925 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MDH1P40925 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MDH1P40925 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MDH1P40925 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MDH1P40925 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MDH1P40925 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDH1P40925 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDH1P40925 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MDH1P40925 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MDH1P40925 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MDH1P40925 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MDH1P40925 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MDH1P40925 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDH1P40925 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDH1P40925 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDH1P40925 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDH1P40925 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MDH1P40925 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MDH1P40925 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDH1P40925 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDH1P40925 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MDH1P40925 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MDH1P40925 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MDH1P40925 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MDH1P40925 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MDH1P40925 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MDH1P40925 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MDH1P40925 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MDH1P40925 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MDH1P40925 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MDH1P40925 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MDH1P40925 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MDH1P40925 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDH1P40925 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDH1P40925 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDH1P40925 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MDH1P40925 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MDH1P40925 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MDH1P40925 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MDH1P40925 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MDH1P40925 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MDH1P40925 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MDH1P40925 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MDH1P40925 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MDH1P40925 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MDH1P40925 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MDH1P40925 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MDH1P40925 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MDH1P40925 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MDH1P40925 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MDH1P40925 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MDH1P40925 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MDH1P40925 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MDH1P40925 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MDH1P40925 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MDH1P40925 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MDH1P40925 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms