Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
COPB2P35606 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
COPB2P35606 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
COPB2P35606 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
COPB2P35606 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
COPB2P35606 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
COPB2P35606 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
COPB2P35606 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COPB2P35606 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
COPB2P35606 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
COPB2P35606 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
COPB2P35606 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COPB2P35606 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
COPB2P35606 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
COPB2P35606 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
COPB2P35606 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COPB2P35606 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
COPB2P35606 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
COPB2P35606 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
COPB2P35606 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
COPB2P35606 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
COPB2P35606 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
COPB2P35606 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
COPB2P35606 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
COPB2P35606 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
COPB2P35606 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
COPB2P35606 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
COPB2P35606 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
COPB2P35606 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
COPB2P35606 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
COPB2P35606 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
COPB2P35606 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
COPB2P35606 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
COPB2P35606 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
COPB2P35606 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
COPB2P35606 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
COPB2P35606 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
COPB2P35606 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
COPB2P35606 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
COPB2P35606 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
COPB2P35606 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
COPB2P35606 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
COPB2P35606 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
COPB2P35606 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
COPB2P35606 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COPB2P35606 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
COPB2P35606 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
COPB2P35606 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
COPB2P35606 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
COPB2P35606 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
COPB2P35606 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
COPB2P35606 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COPB2P35606 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COPB2P35606 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
COPB2P35606 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
COPB2P35606 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
COPB2P35606 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
COPB2P35606 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
COPB2P35606 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
COPB2P35606 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
COPB2P35606 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COPB2P35606 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COPB2P35606 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
COPB2P35606 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
COPB2P35606 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
COPB2P35606 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COPB2P35606 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COPB2P35606 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COPB2P35606 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COPB2P35606 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
COPB2P35606 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
COPB2P35606 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
COPB2P35606 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
COPB2P35606 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
COPB2P35606 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
COPB2P35606 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
COPB2P35606 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
COPB2P35606 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COPB2P35606 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COPB2P35606 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
COPB2P35606 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
COPB2P35606 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
COPB2P35606 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
COPB2P35606 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
COPB2P35606 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
COPB2P35606 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
COPB2P35606 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COPB2P35606 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
COPB2P35606 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
COPB2P35606 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
COPB2P35606 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
COPB2P35606 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
COPB2P35606 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
COPB2P35606 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
COPB2P35606 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
COPB2P35606 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COPB2P35606 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COPB2P35606 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COPB2P35606 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
COPB2P35606 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms