Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TM4SF1P30408 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TM4SF1P30408 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TM4SF1P30408 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TM4SF1P30408 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TM4SF1P30408 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TM4SF1P30408 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TM4SF1P30408 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TM4SF1P30408 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TM4SF1P30408 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TM4SF1P30408 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TM4SF1P30408 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TM4SF1P30408 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TM4SF1P30408 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TM4SF1P30408 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TM4SF1P30408 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TM4SF1P30408 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TM4SF1P30408 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TM4SF1P30408 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TM4SF1P30408 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TM4SF1P30408 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TM4SF1P30408 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TM4SF1P30408 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TM4SF1P30408 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TM4SF1P30408 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TM4SF1P30408 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TM4SF1P30408 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TM4SF1P30408 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TM4SF1P30408 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TM4SF1P30408 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TM4SF1P30408 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TM4SF1P30408 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TM4SF1P30408 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TM4SF1P30408 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TM4SF1P30408 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TM4SF1P30408 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
TM4SF1P30408 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TM4SF1P30408 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TM4SF1P30408 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TM4SF1P30408 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TM4SF1P30408 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TM4SF1P30408 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TM4SF1P30408 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TM4SF1P30408 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TM4SF1P30408 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TM4SF1P30408 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TM4SF1P30408 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TM4SF1P30408 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TM4SF1P30408 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TM4SF1P30408 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TM4SF1P30408 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 316 ms