Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALRP27797 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALRP27797 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALRP27797 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALRP27797 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALRP27797 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALRP27797 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALRP27797 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALRP27797 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALRP27797 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALRP27797 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALRP27797 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALRP27797 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALRP27797 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALRP27797 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALRP27797 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALRP27797 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALRP27797 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALRP27797 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALRP27797 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALRP27797 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALRP27797 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALRP27797 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALRP27797 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALRP27797 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALRP27797 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALRP27797 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALRP27797 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALRP27797 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALRP27797 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALRP27797 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALRP27797 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALRP27797 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALRP27797 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALRP27797 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALRP27797 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALRP27797 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALRP27797 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALRP27797 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALRP27797 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALRP27797 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALRP27797 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALRP27797 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALRP27797 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CALRP27797 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALRP27797 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CALRP27797 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CALRP27797 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALRP27797 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALRP27797 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CALRP27797 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CALRP27797 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALRP27797 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALRP27797 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALRP27797 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALRP27797 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALRP27797 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALRP27797 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CALRP27797 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALRP27797 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALRP27797 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALRP27797 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CALRP27797 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CALRP27797 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALRP27797 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALRP27797 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CALRP27797 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALRP27797 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CALRP27797 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALRP27797 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALRP27797 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALRP27797 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CALRP27797 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALRP27797 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALRP27797 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALRP27797 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALRP27797 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALRP27797 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALRP27797 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALRP27797 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALRP27797 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALRP27797 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALRP27797 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALRP27797 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALRP27797 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALRP27797 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALRP27797 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALRP27797 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALRP27797 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALRP27797 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALRP27797 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALRP27797 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALRP27797 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALRP27797 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALRP27797 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALRP27797 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALRP27797 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALRP27797 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALRP27797 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALRP27797 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms