Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HMGB2P26583 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HMGB2P26583 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HMGB2P26583 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGB2P26583 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HMGB2P26583 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
HMGB2P26583 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HMGB2P26583 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HMGB2P26583 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
HMGB2P26583 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
HMGB2P26583 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HMGB2P26583 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HMGB2P26583 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HMGB2P26583 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
HMGB2P26583 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
HMGB2P26583 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HMGB2P26583 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HMGB2P26583 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HMGB2P26583 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HMGB2P26583 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HMGB2P26583 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HMGB2P26583 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HMGB2P26583 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HMGB2P26583 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
HMGB2P26583 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
HMGB2P26583 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HMGB2P26583 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HMGB2P26583 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HMGB2P26583 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HMGB2P26583 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HMGB2P26583 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HMGB2P26583 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HMGB2P26583 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HMGB2P26583 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HMGB2P26583 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
HMGB2P26583 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HMGB2P26583 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HMGB2P26583 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HMGB2P26583 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HMGB2P26583 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HMGB2P26583 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HMGB2P26583 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HMGB2P26583 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HMGB2P26583 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HMGB2P26583 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HMGB2P26583 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
HMGB2P26583 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HMGB2P26583 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms