Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
TRHP20396 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
TRHP20396 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
TRHP20396 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
TRHP20396 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
TRHP20396 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
TRHP20396 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
TRHP20396 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
TRHP20396 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
TRHP20396 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
TRHP20396 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
TRHP20396 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TRHP20396 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TRHP20396 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TRHP20396 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC43.38■■■■■ 4.53
TRHP20396 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
TRHP20396 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
TRHP20396 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
TRHP20396 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
TRHP20396 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
TRHP20396 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
TRHP20396 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
TRHP20396 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
TRHP20396 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
TRHP20396 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRHP20396 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRHP20396 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRHP20396 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRHP20396 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRHP20396 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRHP20396 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRHP20396 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRHP20396 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TRHP20396 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
TRHP20396 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
TRHP20396 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
TRHP20396 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TRHP20396 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TRHP20396 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TRHP20396 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
TRHP20396 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TRHP20396 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TRHP20396 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
TRHP20396 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
TRHP20396 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
TRHP20396 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
TRHP20396 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC43.23■■■■■ 4.51
TRHP20396 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
TRHP20396 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
TRHP20396 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
TRHP20396 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
TRHP20396 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
TRHP20396 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
TRHP20396 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TRHP20396 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
TRHP20396 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
TRHP20396 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
TRHP20396 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
TRHP20396 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
TRHP20396 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
TRHP20396 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
TRHP20396 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
TRHP20396 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
TRHP20396 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
TRHP20396 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
TRHP20396 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
TRHP20396 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
TRHP20396 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
TRHP20396 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
TRHP20396 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
TRHP20396 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
TRHP20396 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
TRHP20396 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
TRHP20396 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
TRHP20396 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
TRHP20396 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
TRHP20396 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
TRHP20396 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
TRHP20396 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
TRHP20396 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC43.07■■■■■ 4.49
TRHP20396 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
TRHP20396 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
TRHP20396 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
TRHP20396 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
TRHP20396 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
TRHP20396 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
TRHP20396 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
TRHP20396 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
TRHP20396 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
TRHP20396 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
TRHP20396 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TRHP20396 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
TRHP20396 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
TRHP20396 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
TRHP20396 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
TRHP20396 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
TRHP20396 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
TRHP20396 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
TRHP20396 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
TRHP20396 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms