Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2A2P16615 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2A2P16615 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2A2P16615 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2A2P16615 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2A2P16615 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2A2P16615 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2A2P16615 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2A2P16615 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2A2P16615 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2A2P16615 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2A2P16615 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2A2P16615 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2A2P16615 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2A2P16615 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2A2P16615 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2A2P16615 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2A2P16615 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2A2P16615 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2A2P16615 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2A2P16615 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2A2P16615 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2A2P16615 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2A2P16615 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2A2P16615 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms