Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXB2P14652 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB2P14652 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXB2P14652 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXB2P14652 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB2P14652 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB2P14652 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB2P14652 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB2P14652 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB2P14652 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB2P14652 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXB2P14652 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB2P14652 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXB2P14652 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXB2P14652 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXB2P14652 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXB2P14652 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXB2P14652 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXB2P14652 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXB2P14652 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXB2P14652 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXB2P14652 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXB2P14652 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXB2P14652 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB2P14652 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB2P14652 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXB2P14652 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms