Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP4P12644 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP4P12644 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BMP4P12644 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BMP4P12644 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP4P12644 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP4P12644 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP4P12644 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP4P12644 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BMP4P12644 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BMP4P12644 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP4P12644 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP4P12644 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BMP4P12644 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP4P12644 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP4P12644 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP4P12644 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BMP4P12644 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP4P12644 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP4P12644 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP4P12644 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP4P12644 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP4P12644 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BMP4P12644 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP4P12644 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP4P12644 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP4P12644 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMP4P12644 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP4P12644 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP4P12644 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BMP4P12644 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMP4P12644 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP4P12644 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP4P12644 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP4P12644 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BMP4P12644 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP4P12644 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP4P12644 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP4P12644 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BMP4P12644 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP4P12644 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP4P12644 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMP4P12644 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP4P12644 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP4P12644 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP4P12644 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP4P12644 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BMP4P12644 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP4P12644 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BMP4P12644 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP4P12644 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP4P12644 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP4P12644 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP4P12644 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMP4P12644 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BMP4P12644 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BMP4P12644 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BMP4P12644 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BMP4P12644 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BMP4P12644 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BMP4P12644 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP4P12644 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP4P12644 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP4P12644 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP4P12644 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP4P12644 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP4P12644 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP4P12644 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP4P12644 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP4P12644 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP4P12644 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP4P12644 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP4P12644 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP4P12644 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP4P12644 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP4P12644 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP4P12644 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP4P12644 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP4P12644 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP4P12644 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP4P12644 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP4P12644 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP4P12644 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP4P12644 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP4P12644 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BMP4P12644 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BMP4P12644 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP4P12644 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP4P12644 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP4P12644 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BMP4P12644 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP4P12644 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP4P12644 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP4P12644 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMP4P12644 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP4P12644 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP4P12644 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMP4P12644 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP4P12644 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BMP4P12644 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms