Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
HOXB7P09629 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HOXB7P09629 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
HOXB7P09629 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HOXB7P09629 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HOXB7P09629 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HOXB7P09629 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HOXB7P09629 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HOXB7P09629 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HOXB7P09629 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HOXB7P09629 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HOXB7P09629 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HOXB7P09629 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HOXB7P09629 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
HOXB7P09629 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HOXB7P09629 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HOXB7P09629 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
HOXB7P09629 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HOXB7P09629 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HOXB7P09629 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HOXB7P09629 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HOXB7P09629 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms