Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC4P09017 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC4P09017 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC4P09017 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXC4P09017 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXC4P09017 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXC4P09017 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXC4P09017 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC4P09017 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms