Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPP00450 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPP00450 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPP00450 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPP00450 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPP00450 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CPP00450 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CPP00450 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CPP00450 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPP00450 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPP00450 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPP00450 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPP00450 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPP00450 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPP00450 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPP00450 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPP00450 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPP00450 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPP00450 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPP00450 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPP00450 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPP00450 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPP00450 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CPP00450 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPP00450 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPP00450 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPP00450 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPP00450 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CPP00450 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CPP00450 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CPP00450 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPP00450 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPP00450 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPP00450 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPP00450 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPP00450 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPP00450 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPP00450 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPP00450 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPP00450 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPP00450 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPP00450 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPP00450 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPP00450 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPP00450 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPP00450 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPP00450 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPP00450 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPP00450 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPP00450 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPP00450 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CPP00450 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPP00450 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CPP00450 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPP00450 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPP00450 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPP00450 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CPP00450 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPP00450 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPP00450 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPP00450 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPP00450 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPP00450 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPP00450 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPP00450 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPP00450 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPP00450 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPP00450 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPP00450 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPP00450 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CPP00450 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPP00450 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPP00450 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPP00450 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPP00450 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPP00450 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPP00450 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPP00450 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPP00450 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPP00450 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPP00450 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPP00450 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPP00450 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPP00450 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPP00450 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPP00450 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPP00450 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPP00450 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPP00450 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPP00450 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPP00450 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPP00450 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPP00450 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPP00450 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPP00450 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPP00450 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPP00450 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPP00450 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPP00450 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPP00450 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms