Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPP00450 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPP00450 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPP00450 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPP00450 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPP00450 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CPP00450 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CPP00450 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CPP00450 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPP00450 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPP00450 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPP00450 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPP00450 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPP00450 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPP00450 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPP00450 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPP00450 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPP00450 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPP00450 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPP00450 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPP00450 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPP00450 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPP00450 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CPP00450 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPP00450 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPP00450 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPP00450 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPP00450 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CPP00450 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CPP00450 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CPP00450 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPP00450 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPP00450 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPP00450 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPP00450 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CPP00450 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CPP00450 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CPP00450 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPP00450 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPP00450 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPP00450 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPP00450 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPP00450 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CPP00450 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPP00450 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPP00450 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPP00450 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPP00450 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPP00450 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPP00450 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPP00450 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CPP00450 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPP00450 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CPP00450 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPP00450 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPP00450 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPP00450 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CPP00450 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPP00450 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CPP00450 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPP00450 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPP00450 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPP00450 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPP00450 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPP00450 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPP00450 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPP00450 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPP00450 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPP00450 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPP00450 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CPP00450 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPP00450 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPP00450 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPP00450 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPP00450 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPP00450 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPP00450 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPP00450 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPP00450 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPP00450 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPP00450 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPP00450 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPP00450 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPP00450 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPP00450 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPP00450 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPP00450 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPP00450 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPP00450 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPP00450 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPP00450 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPP00450 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPP00450 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPP00450 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPP00450 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPP00450 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPP00450 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPP00450 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPP00450 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPP00450 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms