Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NPTXRO95502 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPTXRO95502 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPTXRO95502 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NPTXRO95502 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPTXRO95502 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NPTXRO95502 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NPTXRO95502 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NPTXRO95502 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NPTXRO95502 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NPTXRO95502 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPTXRO95502 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NPTXRO95502 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPTXRO95502 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPTXRO95502 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NPTXRO95502 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NPTXRO95502 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms