Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATE1O95260 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATE1O95260 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATE1O95260 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATE1O95260 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATE1O95260 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATE1O95260 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATE1O95260 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATE1O95260 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATE1O95260 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATE1O95260 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATE1O95260 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATE1O95260 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATE1O95260 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATE1O95260 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATE1O95260 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATE1O95260 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATE1O95260 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATE1O95260 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATE1O95260 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATE1O95260 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATE1O95260 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATE1O95260 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATE1O95260 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATE1O95260 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATE1O95260 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATE1O95260 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATE1O95260 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATE1O95260 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATE1O95260 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATE1O95260 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATE1O95260 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATE1O95260 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATE1O95260 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATE1O95260 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATE1O95260 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATE1O95260 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATE1O95260 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATE1O95260 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATE1O95260 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATE1O95260 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATE1O95260 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATE1O95260 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATE1O95260 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATE1O95260 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATE1O95260 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATE1O95260 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATE1O95260 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATE1O95260 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATE1O95260 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATE1O95260 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATE1O95260 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATE1O95260 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATE1O95260 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATE1O95260 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATE1O95260 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATE1O95260 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATE1O95260 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATE1O95260 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATE1O95260 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATE1O95260 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATE1O95260 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATE1O95260 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATE1O95260 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATE1O95260 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATE1O95260 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATE1O95260 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATE1O95260 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATE1O95260 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATE1O95260 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATE1O95260 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATE1O95260 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATE1O95260 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATE1O95260 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATE1O95260 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATE1O95260 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATE1O95260 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATE1O95260 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATE1O95260 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATE1O95260 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATE1O95260 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATE1O95260 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATE1O95260 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATE1O95260 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATE1O95260 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATE1O95260 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATE1O95260 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATE1O95260 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATE1O95260 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATE1O95260 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATE1O95260 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATE1O95260 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATE1O95260 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATE1O95260 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATE1O95260 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATE1O95260 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATE1O95260 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATE1O95260 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATE1O95260 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATE1O95260 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms