Protein–RNA interactions for Protein: O95255

ABCC6, Multidrug resistance-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC6O95255 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCC6O95255 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC6O95255 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC6O95255 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCC6O95255 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC6O95255 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC6O95255 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC6O95255 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC6O95255 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC6O95255 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC6O95255 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC6O95255 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC6O95255 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC6O95255 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC6O95255 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC6O95255 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC6O95255 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCC6O95255 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCC6O95255 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC6O95255 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC6O95255 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC6O95255 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC6O95255 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC6O95255 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC6O95255 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC6O95255 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC6O95255 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC6O95255 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC6O95255 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC6O95255 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC6O95255 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC6O95255 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC6O95255 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC6O95255 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC6O95255 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC6O95255 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC6O95255 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC6O95255 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC6O95255 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC6O95255 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ABCC6O95255 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC6O95255 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC6O95255 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC6O95255 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC6O95255 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC6O95255 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC6O95255 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC6O95255 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC6O95255 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ABCC6O95255 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ABCC6O95255 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ABCC6O95255 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ABCC6O95255 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ABCC6O95255 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ABCC6O95255 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ABCC6O95255 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ABCC6O95255 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC6O95255 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC6O95255 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC6O95255 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC6O95255 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC6O95255 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC6O95255 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC6O95255 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC6O95255 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC6O95255 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC6O95255 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC6O95255 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC6O95255 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ABCC6O95255 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ABCC6O95255 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ABCC6O95255 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC6O95255 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ABCC6O95255 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ABCC6O95255 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC6O95255 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC6O95255 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC6O95255 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC6O95255 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ABCC6O95255 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ABCC6O95255 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ABCC6O95255 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC6O95255 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC6O95255 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC6O95255 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC6O95255 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC6O95255 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC6O95255 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC6O95255 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC6O95255 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ABCC6O95255 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC6O95255 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms