Protein–RNA interactions for Protein: O94868

FCHSD2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHSD2O94868 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FCHSD2O94868 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FCHSD2O94868 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FCHSD2O94868 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FCHSD2O94868 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FCHSD2O94868 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FCHSD2O94868 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
FCHSD2O94868 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
FCHSD2O94868 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
FCHSD2O94868 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
FCHSD2O94868 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
FCHSD2O94868 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
FCHSD2O94868 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
FCHSD2O94868 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
FCHSD2O94868 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
FCHSD2O94868 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FCHSD2O94868 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FCHSD2O94868 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FCHSD2O94868 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FCHSD2O94868 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FCHSD2O94868 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FCHSD2O94868 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FCHSD2O94868 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FCHSD2O94868 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FCHSD2O94868 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FCHSD2O94868 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FCHSD2O94868 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FCHSD2O94868 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FCHSD2O94868 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FCHSD2O94868 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FCHSD2O94868 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms