Protein–RNA interactions for Protein: O75971

SNAPC5, snRNA-activating protein complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC5O75971 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAPC5O75971 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAPC5O75971 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAPC5O75971 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAPC5O75971 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAPC5O75971 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPC5O75971 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPC5O75971 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC5O75971 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC5O75971 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC5O75971 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAPC5O75971 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAPC5O75971 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAPC5O75971 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAPC5O75971 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAPC5O75971 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPC5O75971 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAPC5O75971 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAPC5O75971 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAPC5O75971 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAPC5O75971 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAPC5O75971 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAPC5O75971 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPC5O75971 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPC5O75971 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPC5O75971 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPC5O75971 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAPC5O75971 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC5O75971 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms