Protein–RNA interactions for Protein: O75949

FAM155B, Transmembrane protein FAM155B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM155BO75949 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM155BO75949 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM155BO75949 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM155BO75949 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM155BO75949 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM155BO75949 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FAM155BO75949 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM155BO75949 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM155BO75949 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM155BO75949 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM155BO75949 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM155BO75949 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM155BO75949 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM155BO75949 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM155BO75949 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM155BO75949 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM155BO75949 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM155BO75949 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM155BO75949 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM155BO75949 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM155BO75949 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM155BO75949 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM155BO75949 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM155BO75949 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM155BO75949 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM155BO75949 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM155BO75949 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM155BO75949 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM155BO75949 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM155BO75949 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM155BO75949 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM155BO75949 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM155BO75949 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM155BO75949 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM155BO75949 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM155BO75949 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM155BO75949 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM155BO75949 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM155BO75949 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms