Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TDRD6O60522 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TDRD6O60522 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TDRD6O60522 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TDRD6O60522 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TDRD6O60522 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TDRD6O60522 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TDRD6O60522 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TDRD6O60522 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD6O60522 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD6O60522 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD6O60522 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD6O60522 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD6O60522 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TDRD6O60522 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TDRD6O60522 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD6O60522 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TDRD6O60522 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TDRD6O60522 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TDRD6O60522 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms