Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN3BO60391 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN3BO60391 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN3BO60391 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN3BO60391 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN3BO60391 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN3BO60391 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN3BO60391 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.8■■■■□ 3
GRIN3BO60391 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN3BO60391 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN3BO60391 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN3BO60391 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
GRIN3BO60391 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GRIN3BO60391 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN3BO60391 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN3BO60391 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN3BO60391 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN3BO60391 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN3BO60391 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN3BO60391 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN3BO60391 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN3BO60391 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN3BO60391 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN3BO60391 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GRIN3BO60391 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN3BO60391 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GRIN3BO60391 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN3BO60391 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GRIN3BO60391 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN3BO60391 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN3BO60391 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN3BO60391 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN3BO60391 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GRIN3BO60391 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN3BO60391 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GRIN3BO60391 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GRIN3BO60391 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN3BO60391 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN3BO60391 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GRIN3BO60391 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN3BO60391 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GRIN3BO60391 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GRIN3BO60391 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN3BO60391 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN3BO60391 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN3BO60391 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN3BO60391 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN3BO60391 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN3BO60391 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN3BO60391 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms