Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BNIP3LO60238 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BNIP3LO60238 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BNIP3LO60238 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BNIP3LO60238 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BNIP3LO60238 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms