Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COCHO43405 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COCHO43405 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COCHO43405 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COCHO43405 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COCHO43405 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COCHO43405 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COCHO43405 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COCHO43405 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COCHO43405 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COCHO43405 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COCHO43405 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COCHO43405 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COCHO43405 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COCHO43405 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COCHO43405 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COCHO43405 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COCHO43405 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COCHO43405 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COCHO43405 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COCHO43405 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COCHO43405 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COCHO43405 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COCHO43405 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COCHO43405 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COCHO43405 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COCHO43405 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COCHO43405 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COCHO43405 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COCHO43405 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COCHO43405 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COCHO43405 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COCHO43405 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COCHO43405 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COCHO43405 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COCHO43405 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COCHO43405 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COCHO43405 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COCHO43405 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COCHO43405 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
COCHO43405 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COCHO43405 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COCHO43405 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COCHO43405 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COCHO43405 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COCHO43405 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COCHO43405 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COCHO43405 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COCHO43405 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COCHO43405 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COCHO43405 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COCHO43405 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COCHO43405 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COCHO43405 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COCHO43405 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COCHO43405 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COCHO43405 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COCHO43405 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COCHO43405 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COCHO43405 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COCHO43405 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COCHO43405 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COCHO43405 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COCHO43405 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COCHO43405 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
COCHO43405 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COCHO43405 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COCHO43405 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COCHO43405 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COCHO43405 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COCHO43405 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COCHO43405 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COCHO43405 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COCHO43405 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COCHO43405 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COCHO43405 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
COCHO43405 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COCHO43405 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COCHO43405 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COCHO43405 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
COCHO43405 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COCHO43405 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COCHO43405 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COCHO43405 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COCHO43405 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COCHO43405 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COCHO43405 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COCHO43405 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COCHO43405 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COCHO43405 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COCHO43405 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COCHO43405 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COCHO43405 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
COCHO43405 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
COCHO43405 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COCHO43405 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COCHO43405 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COCHO43405 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COCHO43405 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COCHO43405 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms