Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPTLC1O15269 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPTLC1O15269 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPTLC1O15269 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPTLC1O15269 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SPTLC1O15269 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPTLC1O15269 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPTLC1O15269 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPTLC1O15269 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPTLC1O15269 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPTLC1O15269 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPTLC1O15269 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms