Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC16AO15027 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC16AO15027 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC16AO15027 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC16AO15027 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC16AO15027 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC16AO15027 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms