Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.44■■■■■ 5.18
CUX2O14529 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC47.44■■■■■ 5.18
CUX2O14529 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC47.43■■■■■ 5.18
CUX2O14529 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC47.41■■■■■ 5.18
CUX2O14529 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
CUX2O14529 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC47.38■■■■■ 5.18
CUX2O14529 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC47.37■■■■■ 5.17
CUX2O14529 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
CUX2O14529 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
CUX2O14529 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
CUX2O14529 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
CUX2O14529 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
CUX2O14529 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC47.31■■■■■ 5.16
CUX2O14529 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
CUX2O14529 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
CUX2O14529 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
CUX2O14529 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC47.29■■■■■ 5.16
CUX2O14529 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
CUX2O14529 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
CUX2O14529 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
CUX2O14529 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC47.27■■■■■ 5.16
CUX2O14529 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.26■■■■■ 5.16
CUX2O14529 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
CUX2O14529 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC47.24■■■■■ 5.15
CUX2O14529 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC47.23■■■■■ 5.15
CUX2O14529 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
CUX2O14529 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC47.22■■■■■ 5.15
CUX2O14529 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC47.21■■■■■ 5.15
CUX2O14529 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
CUX2O14529 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
CUX2O14529 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
CUX2O14529 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
CUX2O14529 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.14
CUX2O14529 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
CUX2O14529 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC47.17■■■■■ 5.14
CUX2O14529 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CUX2O14529 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CUX2O14529 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
CUX2O14529 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC47.16■■■■■ 5.14
CUX2O14529 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CUX2O14529 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CUX2O14529 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CUX2O14529 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CUX2O14529 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CUX2O14529 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CUX2O14529 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CUX2O14529 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
CUX2O14529 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
CUX2O14529 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
CUX2O14529 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CUX2O14529 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
CUX2O14529 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
CUX2O14529 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
CUX2O14529 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
CUX2O14529 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
CUX2O14529 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
CUX2O14529 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.02■■■■■ 5.12
CUX2O14529 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
CUX2O14529 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC47.02■■■■■ 5.12
CUX2O14529 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
CUX2O14529 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
CUX2O14529 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
CUX2O14529 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
CUX2O14529 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
CUX2O14529 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
CUX2O14529 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
CUX2O14529 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
CUX2O14529 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
CUX2O14529 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
CUX2O14529 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
CUX2O14529 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.12
CUX2O14529 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
CUX2O14529 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.96■■■■■ 5.11
CUX2O14529 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
CUX2O14529 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
CUX2O14529 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
CUX2O14529 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC46.92■■■■■ 5.1
CUX2O14529 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
CUX2O14529 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
CUX2O14529 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
CUX2O14529 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
CUX2O14529 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
CUX2O14529 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
CUX2O14529 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC46.88■■■■■ 5.09
CUX2O14529 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
CUX2O14529 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
CUX2O14529 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
CUX2O14529 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC46.83■■■■■ 5.09
CUX2O14529 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC46.81■■■■■ 5.08
CUX2O14529 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
CUX2O14529 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
CUX2O14529 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
CUX2O14529 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
CUX2O14529 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC46.78■■■■■ 5.08
CUX2O14529 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
CUX2O14529 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
CUX2O14529 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
CUX2O14529 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC46.76■■■■■ 5.08
CUX2O14529 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
CUX2O14529 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
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