Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM49D1C9J1S8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM49D1C9J1S8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM49D1C9J1S8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM49D1C9J1S8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM49D1C9J1S8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM49D1C9J1S8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM49D1C9J1S8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM49D1C9J1S8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM49D1C9J1S8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM49D1C9J1S8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM49D1C9J1S8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM49D1C9J1S8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM49D1C9J1S8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49D1C9J1S8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM49D1C9J1S8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM49D1C9J1S8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM49D1C9J1S8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms