Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ46

NKX6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-3A6NJ46 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX6-3A6NJ46 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX6-3A6NJ46 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX6-3A6NJ46 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX6-3A6NJ46 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX6-3A6NJ46 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX6-3A6NJ46 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX6-3A6NJ46 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms