Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01546A6NGU7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01546A6NGU7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01546A6NGU7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01546A6NGU7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01546A6NGU7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC01546A6NGU7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC01546A6NGU7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC01546A6NGU7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01546A6NGU7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01546A6NGU7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01546A6NGU7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC01546A6NGU7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms