Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCCD1A6NED2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RCCD1A6NED2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCCD1A6NED2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCCD1A6NED2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RCCD1A6NED2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RCCD1A6NED2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCCD1A6NED2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCCD1A6NED2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCCD1A6NED2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCCD1A6NED2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCCD1A6NED2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCCD1A6NED2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCCD1A6NED2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCCD1A6NED2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCCD1A6NED2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCCD1A6NED2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCCD1A6NED2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RCCD1A6NED2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RCCD1A6NED2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCCD1A6NED2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCCD1A6NED2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RCCD1A6NED2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCCD1A6NED2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCCD1A6NED2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCCD1A6NED2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCCD1A6NED2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCCD1A6NED2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RCCD1A6NED2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RCCD1A6NED2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCCD1A6NED2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms