Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CA9Q16790 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CA9Q16790 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CA9Q16790 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CA9Q16790 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CA9Q16790 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CA9Q16790 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CA9Q16790 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA9Q16790 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA9Q16790 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA9Q16790 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA9Q16790 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA9Q16790 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA9Q16790 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA9Q16790 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA9Q16790 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA9Q16790 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CA9Q16790 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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