Protein–RNA interactions for Protein: Q12269

TY1B-GR2, Transposon Ty1-GR2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR2Q12269 MEC1YBR136W 7107 nt2.4□□□□□ -2.02
TY1B-GR2Q12269 PFD1YJL179W 330 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 YJR023CYJR023C 402 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 DID4YKL002W 699 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 DAD2YKR083C 402 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 DSE3YOR264W 1293 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 DAD3YBR233W-A 285 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 LDB17YDL146W 1476 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 HSL1YKL101W 4557 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 GEA2YEL022W 4380 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 LAP3YNL239W 1365 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 SMI1YGR229C 1518 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 HMO1YDR174W 741 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 PHS1YJL097W 654 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 YJU2YKL095W 837 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 SPO20YMR017W 1194 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 RPS30BYOR182C 192 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 SSF1YHR066W 1362 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 SOK2YMR016C 2358 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 TOR2YKL203C 7425 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 YGL176CYGL176C 1665 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 DNF3YMR162C 4971 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 CPR5YDR304C 678 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 YOR146WYOR146W 306 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 RRI1YDL216C 1323 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 ENV10YLR065C 546 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 POC4YPL144W 447 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 YLR419WYLR419W 4308 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 YDR401WYDR401W 564 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 RSM25YIL093C 795 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 AIM23YJL131C 1071 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 COQ9YLR201C 783 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 PGS1YCL004W 1566 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 PAU2YEL049W 363 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 PAU12YGR294W 363 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 PAU18YLL064C 363 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 PDR8YLR266C 2106 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 CPR8YNR028W 927 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 PAU6YNR076W 363 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 PAU24YBR301W 363 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 HDA2YDR295C 2025 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 RNY1YPL123C 1305 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 SEC65YML105C 822 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1B-GR2Q12269 PHO2YDL106C 1680 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 MED2YDL005C 1296 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 SWC4YGR002C 1431 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 MSH5YDL154W 2706 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 TRZ1YKR079C 2517 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 TRA1YHR099W 11235 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 ISW1YBR245C 3390 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 OKP1YGR179C 1221 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 LSM1YJL124C 519 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 RPS1AYLR441C 768 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 UTP21YLR409C 2820 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 ATP11YNL315C 957 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 HUA2YOR284W 732 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 YPR027CYPR027C 834 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 MDM10YAL010C 1482 nt2.32□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 CWC22YGR278W 1734 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 HMT1YBR034C 1047 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 TOP1YOL006C 2310 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 NOP14YDL148C 2433 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 NAN1YPL126W 2691 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 NRP1YDL167C 2160 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 TRX1YLR043C 312 nt2.31□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 YOL057WYOL057W 2136 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 PHO12YHR215W 1404 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 PHO11YAR071W 1404 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 SRG1SRG1 551 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 SMX2YFL017W-A 234 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 SWD3YBR175W 948 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 ROM2YLR371W 4071 nt2.3□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 CTF13YMR094W 1437 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 YHR095WYHR095W 495 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 YJR056CYJR056C 711 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 REC102YLR329W 795 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 ATG34YOL083W 1239 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 IRE1YHR079C 3348 nt2.29□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 MAK10YEL053C 2202 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 YFR045WYFR045W 930 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 YGR293CYGR293C 462 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 RRP7YCL031C 894 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 MSM1YGR171C 1728 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 GNT1YOR320C 1476 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 PRP6YBR055C 2700 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 GPP2YER062C 753 nt2.28□□□□□ -2.04
TY1B-GR2Q12269 VBA4YDR119W 2307 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1B-GR2Q12269 CSF1YLR087C 8877 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1B-GR2Q12269 SDP1YIL113W 630 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1B-GR2Q12269 CFT2YLR115W 2580 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1B-GR2Q12269 TMA64YDR117C 1698 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1B-GR2Q12269 RIM13YMR154C 2184 nt2.27□□□□□ -2.05
TY1B-GR2Q12269 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-GR2Q12269 FIN1YDR130C 876 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-GR2Q12269 HHF2YNL030W 312 nt2.26□□□□□ -2.05
TY1B-GR2Q12269 NNT1YLR285W 786 nt2.25□□□□□ -2.05
TY1B-GR2Q12269 YLR462WYLR462W 609 nt2.25□□□□□ -2.05
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