Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00205P59089 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms