Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 UTP23YOR004W 765 nt3.6□□□□□ -1.83
PUS4P48567 RCN2YOR220W 798 nt3.6□□□□□ -1.83
PUS4P48567 YOR364WYOR364W 369 nt3.6□□□□□ -1.83
PUS4P48567 YPR053CYPR053C 456 nt3.6□□□□□ -1.83
PUS4P48567 MBA1YBR185C 837 nt3.6□□□□□ -1.83
PUS4P48567 YLR177WYLR177W 1887 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS4P48567 CWH41YGL027C 2502 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS4P48567 SRD1YCR018C 666 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS4P48567 YCR108CYCR108C 192 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS4P48567 NCB2YDR397C 441 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS4P48567 VAR1Q0140 1197 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS4P48567 YGL214WYGL214W 486 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS4P48567 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS4P48567 YJL119CYJL119C 324 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS4P48567 VPS63YLR261C 327 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS4P48567 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt3.59□□□□□ -1.83
PUS4P48567 PEX6YNL329C 3093 nt3.59□□□□□ -1.84
PUS4P48567 FOX2YKR009C 2703 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 PEX5YDR244W 1839 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 SSE2YBR169C 2082 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 PDX1YGR193C 1233 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YGR290WYGR290W 444 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 BCD1YHR040W 1101 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 PCL5YHR071W 690 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YLR257WYLR257W 966 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 ATP18YML081C-A 180 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 FSH3YOR280C 801 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 MRPS9YBR146W 837 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 BRE5YNR051C 1548 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 RAD26YJR035W 3258 nt3.58□□□□□ -1.84
PUS4P48567 FKH2YNL068C 2589 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YGL039WYGL039W 1047 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS4P48567 GIC1YHR061C 945 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS4P48567 MNL1YHR204W 2391 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS4P48567 LSM1YJL124C 519 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS4P48567 ATX1YNL259C 222 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS4P48567 ECM23YPL021W 564 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YPL088WYPL088W 1029 nt3.57□□□□□ -1.84
PUS4P48567 TGL3YMR313C 1929 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 AFR1YDR085C 1863 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 NEL1YHR035W 1893 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 ABP140YOR239W 1887 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YDR061WYDR061W 1620 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 NOP12YOL041C 1380 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 RPL1BYGL135W 654 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YGR228WYGR228W 345 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YIL029CYIL029C 429 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 IME1YJR094C 1083 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YNL150WYNL150W 408 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 CSI2YOL007C 1026 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 RPL1AYPL220W 654 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 MUS81YDR386W 1899 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 JJJ1YNL227C 1773 nt3.56□□□□□ -1.84
PUS4P48567 MYO3YKL129C 3819 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 PHM7YOL084W 2976 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 PWP2YCR057C 2772 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 CDC40YDR364C 1368 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YDR115WYDR115W 318 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 RTT105YER104W 627 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 PEA2YER149C 1263 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 FAR7YFR008W 666 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 MIC19YFR011C 513 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 RPL11BYGR085C 525 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YNK1YKL067W 462 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 MSN1YOL116W 1149 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 PEX11YOL147C 711 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 snR17asnR17a 333 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 MRPL40YPL173W 894 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 RPL11AYPR102C 525 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 SCD6YPR129W 1050 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 RPN3YER021W 1572 nt3.55□□□□□ -1.84
PUS4P48567 JEN1YKL217W 1851 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 FMP25YLR077W 1752 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 CIN1YOR349W 3045 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YDL016CYDL016C 303 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 FIN1YDR130C 876 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YER034WYER034W 558 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 LIF1YGL090W 1266 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YHL026CYHL026C 948 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 ILM1YJR118C 612 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 PET123YOR158W 957 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 TPK2YPL203W 1143 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 TCB3YML072C 4638 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 FRE8YLR047C 2061 nt3.54□□□□□ -1.84
PUS4P48567 ZDS2YML109W 2829 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS4P48567 MLH2YLR035C 2088 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS4P48567 SIZ1YDR409W 2715 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS4P48567 SHS1YDL225W 1656 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YFR054CYFR054C 579 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS4P48567 UBX4YMR067C 1251 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS4P48567 YPR077CYPR077C 372 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS4P48567 GCR1YPL075W 2358 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS4P48567 DIT2YDR402C 1470 nt3.53□□□□□ -1.84
PUS4P48567 KAR9YPL269W 1935 nt3.52□□□□□ -1.85
PUS4P48567 SNA4YDL123W 423 nt3.52□□□□□ -1.85
PUS4P48567 CPR5YDR304C 678 nt3.52□□□□□ -1.85
PUS4P48567 MIG3YER028C 1185 nt3.52□□□□□ -1.85
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