RNA–Protein interactions for RNA: YOL007C

CSI2, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene CSI2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2YOL007C MTC1P47018 478 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CSI2YOL007C FAP1P53971 965 aa14.61□□□□□ -0.07
CSI2YOL007C DRS1P32892 752 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CSI2YOL007C PRY3P47033 881 aa13.75□□□□□ -0.21
CSI2YOL007C PRI1P10363 409 aa13.53□□□□□ -0.24
CSI2YOL007C AAD16Q02895 342 aa13.48□□□□□ -0.25
CSI2YOL007C ISW2Q08773 1120 aa13.18□□□□□ -0.3
CSI2YOL007C RPG1P38249 964 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CSI2YOL007C YCK3P39962 524 aa13.01□□□□□ -0.33
CSI2YOL007C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CSI2YOL007C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
CSI2YOL007C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CSI2YOL007C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CSI2YOL007C AVT3P36062 692 aa12.27□□□□□ -0.45
CSI2YOL007C MRPL32P25348 183 aa12.26□□□□□ -0.45
CSI2YOL007C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CSI2YOL007C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CSI2YOL007C REB1P21538 810 aa12.07□□□□□ -0.48
CSI2YOL007C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CSI2YOL007C YGL015CP33199 130 aa11.83□□□□□ -0.52
CSI2YOL007C CDC27P38042 758 aa11.63□□□□□ -0.55
CSI2YOL007C SPT21P35209 758 aa11.57□□□□□ -0.56
CSI2YOL007C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CSI2YOL007C MAP2P38174 421 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CSI2YOL007C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CSI2YOL007C HOP09932 586 aa11.29□□□□□ -0.6
CSI2YOL007C TFC8Q12308 588 aa11.27□□□□□ -0.61
CSI2YOL007C DCD1P06773 312 aa11.26□□□□□ -0.61
CSI2YOL007C RIM101P33400 625 aa11.09□□□□□ -0.63
CSI2YOL007C SCY1P53009 804 aa11.01□□□□□ -0.65
CSI2YOL007C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CSI2YOL007C BCH2P36122 765 aa10.89□□□□□ -0.67
CSI2YOL007C SLX5P32828 619 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
CSI2YOL007C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CSI2YOL007C TGL3P40308 642 aa10.79□□□□□ -0.68
CSI2YOL007C OXP1P28273 1286 aa10.72□□□□□ -0.69
CSI2YOL007C EPS1P40557 701 aa10.6□□□□□ -0.71
CSI2YOL007C BDF1P35817 686 aa10.56□□□□□ -0.72
CSI2YOL007C PTP3P40048 928 aa10.55□□□□□ -0.72
CSI2YOL007C UBP9P39967 754 aa10.54□□□□□ -0.72
CSI2YOL007C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CSI2YOL007C SIS1P25294 352 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CSI2YOL007C RSM7P47150 247 aa10.39□□□□□ -0.75
CSI2YOL007C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CSI2YOL007C AI2P03876 854 aa10.33□□□□□ -0.76
CSI2YOL007C BBC1P47068 1157 aa10.33□□□□□ -0.76
CSI2YOL007C MST1P07236 462 aa10.31□□□□□ -0.76
CSI2YOL007C YOR238WQ08634 303 aa10.26□□□□□ -0.77
CSI2YOL007C TFA1P36100 482 aa10.23□□□□□ -0.77
CSI2YOL007C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data10.22□□□□□ -0.77not detected
CSI2YOL007C YBL029C-AQ3E756 94 aa10.21□□□□□ -0.77
CSI2YOL007C YLR271WQ06152 274 aa10.18□□□□□ -0.78
CSI2YOL007C YAP5P40574 245 aa10.15□□□□□ -0.78
CSI2YOL007C VNX1P42839 908 aa10.08□□□□□ -0.8
CSI2YOL007C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CSI2YOL007C WSC3Q12215 556 aa10.02□□□□□ -0.81
CSI2YOL007C SPP1Q03012 353 aa9.99□□□□□ -0.81
CSI2YOL007C MRM1P25270 412 aa9.95□□□□□ -0.82
CSI2YOL007C SSP1P38871 571 aa9.95□□□□□ -0.82
CSI2YOL007C GTT3P39996 337 aa9.94□□□□□ -0.82
CSI2YOL007C PIB1Q06651 286 aa9.91□□□□□ -0.82
CSI2YOL007C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data9.9□□□□□ -0.82not detected
CSI2YOL007C TIF11P38912 153 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CSI2YOL007C CST9Q06032 482 aa9.81□□□□□ -0.84
CSI2YOL007C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CSI2YOL007C FKH1P40466 484 aa9.78□□□□□ -0.84
CSI2YOL007C ULI1P43604 169 aa9.75□□□□□ -0.85
CSI2YOL007C MGA2P40578 1113 aa9.74□□□□□ -0.85
CSI2YOL007C VPS29P38759 282 aa9.73□□□□□ -0.85
CSI2YOL007C LDB19Q12502 818 aa9.73□□□□□ -0.85
CSI2YOL007C IOC2Q12072 812 aa9.72□□□□□ -0.85
CSI2YOL007C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.71□□□□□ -0.86not detected
CSI2YOL007C DBP1P24784 617 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CSI2YOL007C RTG3P38165 486 aa9.69□□□□□ -0.86
CSI2YOL007C YJL171CP46992 396 aa9.69□□□□□ -0.86
CSI2YOL007C YFR006WP43590 535 aa9.68□□□□□ -0.86
CSI2YOL007C MSB4Q12317 492 aa9.67□□□□□ -0.86
CSI2YOL007C YOL036WQ08206 761 aa9.65□□□□□ -0.86
CSI2YOL007C STS1P38637 319 aa9.64□□□□□ -0.87
CSI2YOL007C SET4P42948 560 aa9.64□□□□□ -0.87
CSI2YOL007C EAP1P36041 632 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CSI2YOL007C RCR1P38212 213 aa9.62□□□□□ -0.87
CSI2YOL007C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CSI2YOL007C TRP5P00931 707 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CSI2YOL007C BMT6Q12291 365 aa9.56□□□□□ -0.88
CSI2YOL007C RTG1P32607 177 aa9.54□□□□□ -0.88
CSI2YOL007C SAM3Q08986 587 aa9.54□□□□□ -0.88
CSI2YOL007C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CSI2YOL007C NCR1Q12200 1170 aa9.47□□□□□ -0.89
CSI2YOL007C SEC61P32915 480 aa9.43□□□□□ -0.9
CSI2YOL007C GYP5Q12344 894 aa9.4□□□□□ -0.9
CSI2YOL007C ABP1P15891 592 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CSI2YOL007C DAN4P47179 1161 aa9.35□□□□□ -0.91
CSI2YOL007C DCW1P36091 449 aa9.34□□□□□ -0.91
CSI2YOL007C JIP4Q03361 876 aa9.33□□□□□ -0.92
CSI2YOL007C HTA1P04911 132 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CSI2YOL007C HTA2P04912 132 aa9.32□□□□□ -0.92
CSI2YOL007C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CSI2YOL007C SAP30P38429 201 aa9.28□□□□□ -0.92
CSI2YOL007C YEL023CP39992 682 aa9.27□□□□□ -0.93
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