Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 NSR1YGR159C 1245 nt16.73■□□□□ 0.27
PUS4P48567 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.64■□□□□ 0.25
PUS4P48567 NOP1YDL014W 984 nt16.35■□□□□ 0.21
PUS4P48567 YKL036CYKL036C 393 nt14.92□□□□□ -0.02
PUS4P48567 MDJ1YFL016C 1536 nt14.68□□□□□ -0.06
PUS4P48567 Q0297Q0297 156 nt14.2□□□□□ -0.14
PUS4P48567 SRX1YKL086W 384 nt14.19□□□□□ -0.14
PUS4P48567 YJL027CYJL027C 417 nt13.87□□□□□ -0.19
PUS4P48567 SCS3YGL126W 1143 nt13.43□□□□□ -0.26
PUS4P48567 YCR051WYCR051W 669 nt13.38□□□□□ -0.27
PUS4P48567 SSA3YBL075C 1950 nt13.36□□□□□ -0.27
PUS4P48567 Q0182Q0182 405 nt13.17□□□□□ -0.3
PUS4P48567 DBP2YNL112W 1641 nt12.95□□□□□ -0.34
PUS4P48567 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PUS4P48567 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PUS4P48567 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PUS4P48567 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PUS4P48567 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PUS4P48567 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PUS4P48567 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PUS4P48567 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PUS4P48567 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.83□□□□□ -0.36
PUS4P48567 YOL085CYOL085C 342 nt12.83□□□□□ -0.36
PUS4P48567 YBR190WYBR190W 312 nt12.74□□□□□ -0.37
PUS4P48567 RPP1BYDL130W 321 nt12.72□□□□□ -0.37
PUS4P48567 MOT3YMR070W 1473 nt12.7□□□□□ -0.38
PUS4P48567 CCC1YLR220W 969 nt12.58□□□□□ -0.4
PUS4P48567 PKP1YIL042C 1185 nt12.52□□□□□ -0.41
PUS4P48567 RVS167YDR388W 1449 nt12.45□□□□□ -0.42
PUS4P48567 RTC3YHR087W 336 nt12.37□□□□□ -0.43
PUS4P48567 SCJ1YMR214W 1134 nt12.32□□□□□ -0.44
PUS4P48567 SCR1SCR1 522 nt12.11□□□□□ -0.47
PUS4P48567 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.09□□□□□ -0.47
PUS4P48567 ATS1YAL020C 1002 nt12.07□□□□□ -0.48
PUS4P48567 PET122YER153C 765 nt12.06□□□□□ -0.48
PUS4P48567 PUT4YOR348C 1884 nt12.05□□□□□ -0.48
PUS4P48567 SHR5YOL110W 714 nt11.92□□□□□ -0.5
PUS4P48567 YDJ1YNL064C 1230 nt11.81□□□□□ -0.52
PUS4P48567 RRN5YLR141W 1092 nt11.7□□□□□ -0.54
PUS4P48567 SSA4YER103W 1929 nt11.64□□□□□ -0.55
PUS4P48567 POA1YBR022W 534 nt11.6□□□□□ -0.55
PUS4P48567 RPN10YHR200W 807 nt11.58□□□□□ -0.56
PUS4P48567 ARE1YCR048W 1833 nt11.56□□□□□ -0.56
PUS4P48567 URN1YPR152C 1398 nt11.54□□□□□ -0.56
PUS4P48567 SPT5YML010W 3192 nt11.54□□□□□ -0.56
PUS4P48567 BSC6YOL137W 1494 nt11.53□□□□□ -0.56
PUS4P48567 RSB1YOR049C 1065 nt11.49□□□□□ -0.57
PUS4P48567 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.47□□□□□ -0.57
PUS4P48567 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.47□□□□□ -0.57
PUS4P48567 OPI9YLR338W 858 nt11.45□□□□□ -0.58
PUS4P48567 YNL208WYNL208W 600 nt11.42□□□□□ -0.58
PUS4P48567 GAR1YHR089C 618 nt11.39□□□□□ -0.59
PUS4P48567 DEP1YAL013W 1218 nt11.39□□□□□ -0.59
PUS4P48567 SAH1YER043C 1350 nt11.29□□□□□ -0.6
PUS4P48567 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.27□□□□□ -0.6
PUS4P48567 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.27□□□□□ -0.6
PUS4P48567 BDF1YLR399C 2061 nt11.24□□□□□ -0.61
PUS4P48567 PAC11YDR488C 1602 nt11.23□□□□□ -0.61
PUS4P48567 PUN1YLR414C 792 nt11.2□□□□□ -0.62
PUS4P48567 PST2YDR032C 597 nt11.16□□□□□ -0.62
PUS4P48567 BUD23YCR047C 828 nt11.15□□□□□ -0.62
PUS4P48567 YJL225CYJL225C 5277 nt11.13□□□□□ -0.63
PUS4P48567 TAT1YBR069C 1860 nt11.11□□□□□ -0.63
PUS4P48567 SSA1YAL005C 1929 nt11.11□□□□□ -0.63
PUS4P48567 FPS1YLL043W 2010 nt11.09□□□□□ -0.63
PUS4P48567 TIR1YER011W 765 nt11.08□□□□□ -0.64
PUS4P48567 YJR018WYJR018W 363 nt11.05□□□□□ -0.64
PUS4P48567 NVJ2YPR091C 2313 nt11.03□□□□□ -0.64
PUS4P48567 RPP2BYDR382W 333 nt10.94□□□□□ -0.66
PUS4P48567 MEP2YNL142W 1500 nt10.93□□□□□ -0.66
PUS4P48567 PTC2YER089C 1395 nt10.91□□□□□ -0.66
PUS4P48567 NAB2YGL122C 1578 nt10.9□□□□□ -0.67
PUS4P48567 YKL097CYKL097C 411 nt10.82□□□□□ -0.68
PUS4P48567 INM2YDR287W 879 nt10.76□□□□□ -0.69
PUS4P48567 DAL1YIR027C 1383 nt10.71□□□□□ -0.69
PUS4P48567 YMR090WYMR090W 684 nt10.71□□□□□ -0.69
PUS4P48567 YJR120WYJR120W 351 nt10.69□□□□□ -0.7
PUS4P48567 DCW1YKL046C 1350 nt10.65□□□□□ -0.7
PUS4P48567 YGR021WYGR021W 873 nt10.65□□□□□ -0.7
PUS4P48567 YBR220CYBR220C 1683 nt10.63□□□□□ -0.71
PUS4P48567 FIS1YIL065C 468 nt10.63□□□□□ -0.71
PUS4P48567 BDH2YAL061W 1254 nt10.63□□□□□ -0.71
PUS4P48567 SHU1YHL006C 453 nt10.62□□□□□ -0.71
PUS4P48567 FPR4YLR449W 1179 nt10.59□□□□□ -0.71
PUS4P48567 YBL100CYBL100C 315 nt10.57□□□□□ -0.72
PUS4P48567 EMI2YDR516C 1503 nt10.57□□□□□ -0.72
PUS4P48567 PHO4YFR034C 939 nt10.56□□□□□ -0.72
PUS4P48567 YPS1YLR120C 1710 nt10.54□□□□□ -0.72
PUS4P48567 LSM3YLR438C-A 270 nt10.54□□□□□ -0.72
PUS4P48567 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.53□□□□□ -0.72
PUS4P48567 PCH2YBR186W 1695 nt10.51□□□□□ -0.73
PUS4P48567 SEC11YIR022W 504 nt10.51□□□□□ -0.73
PUS4P48567 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.5□□□□□ -0.73
PUS4P48567 WWM1YFL010C 636 nt10.48□□□□□ -0.73
PUS4P48567 SRB2YHR041C 633 nt10.46□□□□□ -0.73
PUS4P48567 SDH1YKL148C 1923 nt10.46□□□□□ -0.74
PUS4P48567 GUT2YIL155C 1950 nt10.46□□□□□ -0.74
PUS4P48567 TRM9YML014W 840 nt10.45□□□□□ -0.74
PUS4P48567 HOM6YJR139C 1080 nt10.44□□□□□ -0.74
PUS4P48567 YDL221WYDL221W 552 nt10.43□□□□□ -0.74
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