Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
N4BP1O75113 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms