Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS51Q9UID3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms