Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPM3Q9P2X0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPM3Q9P2X0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms