Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOPBP1Q92547 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC36■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
TOPBP1Q92547 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TOPBP1Q92547 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms