Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIF1AQ16665 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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