Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
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