Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms