Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms