Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PPARGC1BQ86YN6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PPARGC1BQ86YN6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms