Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 APC5YOR249C 2058 nt3.35□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 DSE1YER124C 1722 nt3.35□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 MSH2YOL090W 2895 nt3.35□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 JEN1YKL217W 1851 nt3.35□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 SSE2YBR169C 2082 nt3.34□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 YDL050CYDL050C 372 nt3.34□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 COBQ0105 1158 nt3.34□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 RGI1YER067W 486 nt3.34□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 CNN1YFR046C 1086 nt3.34□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 FUR1YHR128W 651 nt3.34□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 YIR040CYIR040C 333 nt3.34□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.34□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 COQ5YML110C 924 nt3.34□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 MRPS8YMR158W 468 nt3.34□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 PEX15YOL044W 1152 nt3.34□□□□□ -1.87
CIK1Q01649 BI3Q0115 1554 nt3.34□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 PSP1YDR505C 2526 nt3.33□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 BEM4YPL161C 1902 nt3.33□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 EMP70YLR083C 2004 nt3.33□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 MYO5YMR109W 3660 nt3.33□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 SMX2YFL017W-A 234 nt3.33□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YGL082WYGL082W 1146 nt3.33□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 PSF2YJL072C 642 nt3.33□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 DER1YBR201W 636 nt3.33□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 VPS3YDR495C 3036 nt3.33□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YDL180WYDL180W 1644 nt3.33□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 SIZ1YDR409W 2715 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 PSF1YDR013W 627 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 UPF3YGR072W 1164 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 IGO2YHR132W-A 396 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YLL037WYLL037W 381 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 TEM1YML064C 738 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YIP3YNL044W 531 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 UFE1YOR075W 1041 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 SAS5YOR213C 747 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YBR137WYBR137W 540 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 RIF1YBR275C 5751 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 GCD2YGR083C 1956 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 IRC3YDR332W 2070 nt3.32□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YSP2YDR326C 4317 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YMR317WYMR317W 3423 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 MSD1YPL104W 1977 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 UBC9YDL064W 474 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 LSM4YER112W 564 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 RPL17AYKL180W 555 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YBL065WYBL065W 345 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 DPB3YBR278W 606 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 RED1YLR263W 2484 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 SPP382YLR424W 2127 nt3.31□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 CDH1YGL003C 1701 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 PPQ1YPL179W 1650 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 TCA17YEL048C 459 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 HYM1YKL189W 1200 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 RPC37YKR025W 849 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YNL109WYNL109W 546 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 MCA1YOR197W 1299 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 SRL1YOR247W 633 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 snR44snR44 211 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 HFM1YGL251C 3564 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 TGL3YMR313C 1929 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 TPO5YKL174C 1857 nt3.3□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 CDC5YMR001C 2118 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 RRN6YBL014C 2685 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 UBP8YMR223W 1416 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 FAR1YJL157C 2493 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 LTV1YKL143W 1392 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 RPA12YJR063W 378 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 RPL15AYLR029C 615 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 ENV10YLR065C 546 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YMR141CYMR141C 309 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YCG1YDR325W 3108 nt3.29□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 MNT3YIL014W 1893 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 RDS1YCR106W 2499 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 KAR1YNL188W 1302 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 UBP5YER144C 2418 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 SMC2YFR031C 3513 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 AI3Q0060 1248 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 MFA1YDR461W 111 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 PET54YGR222W 882 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YJR056CYJR056C 711 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 NNF1YJR112W 606 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 YOL114CYOL114C 609 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 TIR2YOR010C 756 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 LTP1YPR073C 486 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 MUS81YDR386W 1899 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 GYL1YMR192W 2163 nt3.28□□□□□ -1.88
CIK1Q01649 VPS33YLR396C 2076 nt3.28□□□□□ -1.89
CIK1Q01649 RTT105YER104W 627 nt3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.7 ms