Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 NSR1YGR159C 1245 nt18.06■□□□□ 0.48
CIK1Q01649 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.6■□□□□ 0.41
CIK1Q01649 NOP1YDL014W 984 nt17.11■□□□□ 0.33
CIK1Q01649 MDJ1YFL016C 1536 nt16.63■□□□□ 0.25
CIK1Q01649 YKL036CYKL036C 393 nt15.68■□□□□ 0.1
CIK1Q01649 YJL027CYJL027C 417 nt15.33■□□□□ 0.04
CIK1Q01649 SSA3YBL075C 1950 nt15.18■□□□□ 0.02
CIK1Q01649 SRX1YKL086W 384 nt14.91□□□□□ -0.02
CIK1Q01649 Q0297Q0297 156 nt14.9□□□□□ -0.02
CIK1Q01649 YBR190WYBR190W 312 nt14.48□□□□□ -0.09
CIK1Q01649 DBP2YNL112W 1641 nt14.44□□□□□ -0.1
CIK1Q01649 SCS3YGL126W 1143 nt14.35□□□□□ -0.11
CIK1Q01649 YCR051WYCR051W 669 nt14.11□□□□□ -0.15
CIK1Q01649 RTC3YHR087W 336 nt14.04□□□□□ -0.16
CIK1Q01649 PUT4YOR348C 1884 nt13.68□□□□□ -0.22
CIK1Q01649 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.65□□□□□ -0.22
CIK1Q01649 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.65□□□□□ -0.22
CIK1Q01649 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.65□□□□□ -0.22
CIK1Q01649 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.65□□□□□ -0.22
CIK1Q01649 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.65□□□□□ -0.22
CIK1Q01649 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.65□□□□□ -0.22
CIK1Q01649 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.65□□□□□ -0.22
CIK1Q01649 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.65□□□□□ -0.22
CIK1Q01649 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.65□□□□□ -0.22
CIK1Q01649 YOL085CYOL085C 342 nt13.6□□□□□ -0.23
CIK1Q01649 CCC1YLR220W 969 nt13.49□□□□□ -0.25
CIK1Q01649 RVS167YDR388W 1449 nt13.47□□□□□ -0.25
CIK1Q01649 RPP1BYDL130W 321 nt13.37□□□□□ -0.27
CIK1Q01649 PKP1YIL042C 1185 nt13.32□□□□□ -0.28
CIK1Q01649 ARE1YCR048W 1833 nt13.2□□□□□ -0.3
CIK1Q01649 SSA4YER103W 1929 nt13.17□□□□□ -0.3
CIK1Q01649 SCJ1YMR214W 1134 nt13.17□□□□□ -0.3
CIK1Q01649 POA1YBR022W 534 nt13.15□□□□□ -0.3
CIK1Q01649 SPT5YML010W 3192 nt13.12□□□□□ -0.31
CIK1Q01649 BSC6YOL137W 1494 nt13.03□□□□□ -0.32
CIK1Q01649 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.01□□□□□ -0.33
CIK1Q01649 SAH1YER043C 1350 nt12.94□□□□□ -0.34
CIK1Q01649 Q0182Q0182 405 nt12.91□□□□□ -0.34
CIK1Q01649 ATS1YAL020C 1002 nt12.91□□□□□ -0.34
CIK1Q01649 OPI9YLR338W 858 nt12.89□□□□□ -0.35
CIK1Q01649 URN1YPR152C 1398 nt12.89□□□□□ -0.35
CIK1Q01649 SHR5YOL110W 714 nt12.82□□□□□ -0.36
CIK1Q01649 BDF1YLR399C 2061 nt12.77□□□□□ -0.36
CIK1Q01649 PET122YER153C 765 nt12.75□□□□□ -0.37
CIK1Q01649 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.75□□□□□ -0.37
CIK1Q01649 PAC11YDR488C 1602 nt12.73□□□□□ -0.37
CIK1Q01649 SCR1SCR1 522 nt12.65□□□□□ -0.38
CIK1Q01649 BUD23YCR047C 828 nt12.63□□□□□ -0.39
CIK1Q01649 DEP1YAL013W 1218 nt12.6□□□□□ -0.39
CIK1Q01649 TAT1YBR069C 1860 nt12.59□□□□□ -0.39
CIK1Q01649 RPN10YHR200W 807 nt12.59□□□□□ -0.39
CIK1Q01649 PUN1YLR414C 792 nt12.52□□□□□ -0.41
CIK1Q01649 PTC2YER089C 1395 nt12.44□□□□□ -0.42
CIK1Q01649 NVJ2YPR091C 2313 nt12.44□□□□□ -0.42
CIK1Q01649 NAB2YGL122C 1578 nt12.43□□□□□ -0.42
CIK1Q01649 YNL208WYNL208W 600 nt12.42□□□□□ -0.42
CIK1Q01649 YDJ1YNL064C 1230 nt12.38□□□□□ -0.43
CIK1Q01649 RRN5YLR141W 1092 nt12.36□□□□□ -0.43
CIK1Q01649 MEP2YNL142W 1500 nt12.35□□□□□ -0.43
CIK1Q01649 YJR018WYJR018W 363 nt12.26□□□□□ -0.45
CIK1Q01649 FIS1YIL065C 468 nt12.15□□□□□ -0.46
CIK1Q01649 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.13□□□□□ -0.47
CIK1Q01649 GAR1YHR089C 618 nt12.13□□□□□ -0.47
CIK1Q01649 DAL1YIR027C 1383 nt12.11□□□□□ -0.47
CIK1Q01649 RSB1YOR049C 1065 nt12.1□□□□□ -0.47
CIK1Q01649 MOT3YMR070W 1473 nt12.08□□□□□ -0.48
CIK1Q01649 DCW1YKL046C 1350 nt12.07□□□□□ -0.48
CIK1Q01649 YPS1YLR120C 1710 nt12.04□□□□□ -0.48
CIK1Q01649 YBR220CYBR220C 1683 nt12□□□□□ -0.49
CIK1Q01649 FPR4YLR449W 1179 nt11.99□□□□□ -0.49
CIK1Q01649 PHO4YFR034C 939 nt11.98□□□□□ -0.49
CIK1Q01649 YMR090WYMR090W 684 nt11.98□□□□□ -0.49
CIK1Q01649 PST2YDR032C 597 nt11.96□□□□□ -0.49
CIK1Q01649 INM2YDR287W 879 nt11.96□□□□□ -0.49
CIK1Q01649 EMI2YDR516C 1503 nt11.93□□□□□ -0.5
CIK1Q01649 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.92□□□□□ -0.5
CIK1Q01649 YJL225CYJL225C 5277 nt11.92□□□□□ -0.5
CIK1Q01649 YJR120WYJR120W 351 nt11.87□□□□□ -0.51
CIK1Q01649 FPS1YLL043W 2010 nt11.86□□□□□ -0.51
CIK1Q01649 PCH2YBR186W 1695 nt11.84□□□□□ -0.51
CIK1Q01649 YDR095CYDR095C 411 nt11.84□□□□□ -0.51
CIK1Q01649 RPP2BYDR382W 333 nt11.84□□□□□ -0.51
CIK1Q01649 GUT2YIL155C 1950 nt11.81□□□□□ -0.52
CIK1Q01649 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.81□□□□□ -0.52
CIK1Q01649 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.81□□□□□ -0.52
CIK1Q01649 SDH1YKL148C 1923 nt11.8□□□□□ -0.52
CIK1Q01649 YDL221WYDL221W 552 nt11.79□□□□□ -0.52
CIK1Q01649 TIR1YER011W 765 nt11.75□□□□□ -0.53
CIK1Q01649 SEC11YIR022W 504 nt11.75□□□□□ -0.53
CIK1Q01649 SSA1YAL005C 1929 nt11.7□□□□□ -0.54
CIK1Q01649 YBL100CYBL100C 315 nt11.68□□□□□ -0.54
CIK1Q01649 CAC2YML102W 1407 nt11.64□□□□□ -0.55
CIK1Q01649 PTP1YDL230W 1008 nt11.62□□□□□ -0.55
CIK1Q01649 RPP2AYOL039W 321 nt11.62□□□□□ -0.55
CIK1Q01649 SCC4YER147C 1875 nt11.61□□□□□ -0.55
CIK1Q01649 PIB2YGL023C 1908 nt11.57□□□□□ -0.56
CIK1Q01649 ALF1YNL148C 765 nt11.52□□□□□ -0.57
CIK1Q01649 FUN26YAL022C 1554 nt11.52□□□□□ -0.57
CIK1Q01649 UME6YDR207C 2511 nt11.52□□□□□ -0.57
CIK1Q01649 YKL097CYKL097C 411 nt11.51□□□□□ -0.57
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