Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2C1P98194 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP2C1P98194 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2C1P98194 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms